More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0065 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  100 
 
 		 463 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  56.31 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  52.93 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  55.56 
 
 		 468 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  55.56 
 
 		 468 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  55.56 
 
 		 468 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  55.32 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  55.32 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  55.32 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  55.32 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  52.32 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  51.64 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  52.32 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  52.25 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  51.31 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  52.25 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  52.1 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  52.25 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  50.34 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  50.34 
 
 		 463 aa  461  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  50.34 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  50.34 
 
 		 463 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  50.34 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  50.34 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  50.34 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  50.57 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  51.7 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  51.1 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  52.15 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  52.15 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  50.11 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  51.91 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  50.87 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  51.82 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  51.93 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  51.47 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  51.25 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  50.44 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  50.66 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  50.66 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  51.01 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  50.66 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  50.66 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  50.88 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  50.66 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  50.66 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  48.3 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  49.21 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  47.84 
 
 		 467 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  47.84 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  50 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  47.84 
 
 		 467 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  48.89 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  47.54 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  49.12 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  49.12 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  49.12 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  49.56 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  48.89 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3297  putative proline-specific permease  49.13 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  47.24 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  48.31 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  47.77 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1046  putative proline-specific permease  49.11 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  47.77 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3372  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  49.12 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  48.01 
 
 		 455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  46.96 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  48.75 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  47.57 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  48.46 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  47.76 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  45.25 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  48.47 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4749  amino acid permease-associated region  51.26 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  46.83 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  48.05 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  48.39 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  47.91 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  44.71 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  46.61 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  47.91 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  46.61 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  47.91 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  48.39 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  47.14 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  44.76 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  44.49 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  48.28 
 
 		 467 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5638  amino acid permease-associated region  48.12 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  48.41 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5046  histidine transport protein  47.16 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.926717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>