More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1895 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1895  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
383 aa  774    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0605  putative acyl-CoA dehydrogenase  63.54 
 
 
382 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00592793  normal  0.0752366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3557  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  57.44 
 
 
386 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5144  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.73 
 
 
385 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7127  Acyl-CoA dehydrogenase  54.69 
 
 
385 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4074  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.21 
 
 
386 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0382192  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2737  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.1 
 
 
385 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0207  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.71 
 
 
387 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.698342  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3624  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.24 
 
 
381 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5357  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.03 
 
 
383 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0369214  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 
410 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.92 
 
 
399 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0061  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.33 
 
 
385 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.957206  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0924  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.8 
 
 
383 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.59 
 
 
386 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1240  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.6 
 
 
640 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4563  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  51.32 
 
 
387 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.68 
 
 
383 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0088  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.07 
 
 
385 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745656  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0079  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.27 
 
 
380 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0907  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.97 
 
 
374 aa  352  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.731697  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6298  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.57 
 
 
379 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5166  Fis family transcriptional regulator  52.37 
 
 
382 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3772  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
378 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0157602  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4154  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 
384 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.041099  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0271  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.83 
 
 
386 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7535  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.43 
 
 
385 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3917  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.07 
 
 
381 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0198331  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0482  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.95 
 
 
386 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0558  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.07 
 
 
386 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.58726  normal  0.0406105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0213  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.79 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.79 
 
 
408 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0203  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.53 
 
 
385 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3278  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.2 
 
 
383 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.827107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2499  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.23 
 
 
371 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0496  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.93 
 
 
400 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6850  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.33 
 
 
378 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5149  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.19 
 
 
393 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1045  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.82 
 
 
398 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0868009  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0845  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.76 
 
 
398 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5530  acyl-CoA dehydrogenase  34.45 
 
 
386 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1442  Acyl-CoA dehydrogenase  35.56 
 
 
400 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100944  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1749  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.03 
 
 
396 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1307  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
398 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1453  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5560  Acyl-CoA dehydrogenase  35.29 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.198235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0430  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.383138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1316  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0720  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.76 
 
 
398 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.59 
 
 
386 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410084  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2149  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.5 
 
 
398 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324611  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2574  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
385 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2256  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2270  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.76 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2731  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4235  pimeloyl-CoA dehydrogenase, large subunit  31.25 
 
 
396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1992  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.99 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.11361  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1620  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.08 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1274  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.43 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2232  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.08 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3393  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.95 
 
 
393 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.389251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3192  putative pimeloyl-CoA dehydrogenase (large subunit), PimC-like  32.91 
 
 
398 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0499  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.41 
 
 
452 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.504662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5374  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.17 
 
 
393 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7116  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.61 
 
 
415 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3557  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33 
 
 
404 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255939  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.54 
 
 
374 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1910  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
414 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.36 
 
 
413 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4958  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.2 
 
 
392 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3727  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.59 
 
 
399 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2615  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.05 
 
 
386 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.766837  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1724  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.47 
 
 
410 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3550  acyl-CoA dehydrogenase-like  31.2 
 
 
396 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.65 
 
 
402 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.322728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3603  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.49 
 
 
411 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0376418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7117  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.49 
 
 
414 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3845  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.39 
 
 
393 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.634206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0960  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.53 
 
 
378 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
381 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2264  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.41 
 
 
402 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0525732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1743  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.17 
 
 
410 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.79 
 
 
393 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2878  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.41 
 
 
402 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.17 
 
 
410 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
379 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.276954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2229  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.73 
 
 
396 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.033637  normal  0.0664218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2889  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.32 
 
 
402 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222228  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6851  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.38 
 
 
399 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1362  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.74 
 
 
398 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0703001  decreased coverage  0.000728046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3605  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.56 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.75816  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3995  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
419 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.30356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7071  putative pimeloyl-CoA dehydrogenase pimC (large subunit)  32.3 
 
 
396 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0736  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 
403 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.453117  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2045  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  32.13 
 
 
398 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.7 
 
 
393 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3604  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.85 
 
 
414 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0502899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>