97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4604 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4604  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1529  hypothetical protein  33.79 
 
 		 1083 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.949689  normal  0.406809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1544  hypothetical protein  24.36 
 
 		 935 aa  127  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1088 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1009 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  24.23 
 
 		 981 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1088 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  26.46 
 
 		 960 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1002 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  28.06 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  28.06 
 
 		 978 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  27.04 
 
 		 978 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1144 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  23.85 
 
 		 950 aa  80.1  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  26.53 
 
 		 978 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  26.29 
 
 		 983 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1061 aa  77  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1011 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1073 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1295 aa  74.3  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  25 
 
 		 1235 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  27.75 
 
 		 1235 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1069 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1281 aa  71.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1181 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  28.96 
 
 		 1266 aa  71.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1067 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1032 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1040 aa  70.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1041 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1158 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  26.87 
 
 		 954 aa  67.4  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1128 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1072 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1169 aa  65.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1154 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  26.67 
 
 		 1275 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  21.59 
 
 		 996 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1074 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  26.7 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1087 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  27.09 
 
 		 982 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1364 aa  61.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  26.58 
 
 		 1081 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  20.24 
 
 		 1151 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1065 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1268 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1135 aa  58.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1298 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1076 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  26.23 
 
 		 1261 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1024 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1013 aa  57.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  22.52 
 
 		 1208 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1271 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1016 aa  57  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1025 aa  56.6  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1337 aa  56.2  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  25.95 
 
 		 1260 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  23.56 
 
 		 1210 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1156 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1268 aa  55.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  24.04 
 
 		 1330 aa  55.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1304 aa  54.7  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  18.53 
 
 		 1264 aa  54.7  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  23.48 
 
 		 1080 aa  54.3  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1124 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1169 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  20.06 
 
 		 1119 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  25.95 
 
 		 1266 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  20.45 
 
 		 1247 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  20.5 
 
 		 1264 aa  51.6  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1189 aa  50.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1277 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1275 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1354 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1275 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1260 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1161 aa  49.7  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  25.71 
 
 		 1216 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1021 aa  48.9  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1022 aa  48.5  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  25.68 
 
 		 595 aa  48.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1187 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1283 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  20.11 
 
 		 1382 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1200 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1197 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1321 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1307 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1307 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1318 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1307 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1307 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1348 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>