162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0072 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0072  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 354 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.08 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4039  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3833  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  23.26 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  20.68 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  22.11 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  22.11 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04830  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  17.42 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  23.59 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  19.14 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2139  extracellular solute-binding protein  20.26 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  24.25 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.5 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  20.95 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  24.75 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  20.46 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.86 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  20.54 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  24.23 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.4 
 
 		 844 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  24.46 
 
 		 266 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  23.51 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  20.6 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  21.74 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.59 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  23.43 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  23.43 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  20.58 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2134  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  normal  0.605089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 325 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28050  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  19.33 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.17 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  20.46 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  24.39 
 
 		 334 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  24.44 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  23.37 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  22.95 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  21.45 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4228  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  22.3 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  21.48 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2897  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  22.28 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  25.13 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  23.84 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3326  Integrase catalytic region  24.16 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.815514 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0115  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.47 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>