102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28050  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  100 
 
 
351 aa  703    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3833  extracellular solute-binding protein family 1  50.6 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4039  extracellular solute-binding protein  48.19 
 
 
359 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2124  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04830  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.46 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  24.1 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  26.37 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.1 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.1 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
322 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.97 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.55 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.57 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  25.87 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.19 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
361 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
348 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
335 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.1 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.99 
 
 
353 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
361 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  28.95 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.92 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.92 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  28.47 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
362 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2099  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.603993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.82 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0072  extracellular solute-binding protein  19.33 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 
368 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 
353 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.11 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 
844 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  26 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.71 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.52 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.81 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  30.89 
 
 
336 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 
338 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.39 
 
 
336 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.68 
 
 
353 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.23 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.33 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  21.03 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.36 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.51 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.08 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  23.78 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.42 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.69 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  25.14 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.42 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0495  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  25.47 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.08 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  35.71 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>