186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1512 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  98.55 
 
 		 344 aa  683    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  47.73 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  42.65 
 
 		 341 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  40.95 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  40.48 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  39.52 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 342 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  38.12 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  37.2 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  37.43 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  36.89 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  36.89 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  35.12 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.91 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.27 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  25.47 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  24.09 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  24.54 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.46 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.46 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  24.46 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  24.46 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.46 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.15 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.46 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.46 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  27.56 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  24.15 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  24.23 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  23.2 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  23.2 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  23.2 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.4 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  27.56 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  22.97 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  24.81 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  23.41 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  24.81 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  24.23 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  23.87 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  24.81 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  24.81 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  24.81 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  25.55 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  23.85 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  23.26 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  22.87 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  22.48 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  24.81 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  23.43 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  29.2 
 
 		 694 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  24.31 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  21.96 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  22.56 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>