86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1309 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  100 
 
 		 343 aa  693    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  41.03 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  37.76 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  35.67 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  35.42 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  35.12 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 		 357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  35.09 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  35.09 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  27.62 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  31.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  31.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  31.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  31.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  28.93 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  25.56 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  28.21 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  23.6 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  26.38 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  26.47 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  36.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  36.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  36.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  36.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  25.33 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  27.41 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  37.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  32.11 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  23.92 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  25.4 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  37.97 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  37.97 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  37.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  37.97 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1704  hypothetical protein  48.94 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.430869  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>