161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3683 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  94.74 
 
 
342 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  94.74 
 
 
342 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  95.03 
 
 
342 aa  668    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  703    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  94.44 
 
 
342 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  66.37 
 
 
339 aa  447  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  63.1 
 
 
339 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
337 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
337 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  45.07 
 
 
337 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  43.12 
 
 
342 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  41.07 
 
 
341 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
340 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
340 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  39.51 
 
 
357 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  37.2 
 
 
344 aa  245  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  36.59 
 
 
344 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  37.16 
 
 
346 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  35.09 
 
 
343 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.7 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.98 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.98 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.98 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  24.05 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  24.05 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  26.98 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  24.33 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  23.48 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  23.11 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  22.99 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.88 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  23.35 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  23.48 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  22.81 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  25.1 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  28.46 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  25.1 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  27.02 
 
 
694 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  26.67 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  24.51 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  24.03 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  24.03 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  24.03 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.19 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  24.03 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  27.45 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  25.21 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  26 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  25.79 
 
 
694 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
310 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  24.9 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  24.9 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.9 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.59 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  24.59 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  24.9 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.59 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.59 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
311 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.9 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  24.42 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  23.69 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  24.42 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>