156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2274 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
357 aa  700    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  45.07 
 
 
339 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  43.9 
 
 
339 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  40.85 
 
 
342 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  40.65 
 
 
341 aa  255  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  39.05 
 
 
340 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
342 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
342 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  37.76 
 
 
337 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
337 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  37.8 
 
 
337 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  40.55 
 
 
342 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  40.55 
 
 
342 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  37.69 
 
 
344 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  37.39 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  37.65 
 
 
342 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  36.72 
 
 
346 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  37.13 
 
 
343 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
335 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  28.48 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.59 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  24.7 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  22.93 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  24.91 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  28.35 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.63 
 
 
700 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  26.4 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  27.14 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  26.81 
 
 
694 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  26.18 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  26.18 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  26.18 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  26.18 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  25.75 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  26.32 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
334 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  30.41 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  30 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  26.69 
 
 
695 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  25.91 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  23.05 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  25.91 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  30.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  25.9 
 
 
317 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  25.9 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  26 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  25.9 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  25.9 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  22.22 
 
 
315 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  22.22 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  22.22 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  22.22 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  22.22 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  22.22 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  22.22 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  27.31 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  26.97 
 
 
694 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  22.63 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  18.96 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  28.57 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  20.35 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  23.27 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  22.62 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  23.36 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  25.77 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
320 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
316 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  21.36 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>