201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2019 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
342 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  44.04 
 
 
341 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  45.68 
 
 
339 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  43.15 
 
 
340 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  44.31 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
340 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
342 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  40.48 
 
 
344 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  40.18 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  42.81 
 
 
342 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
342 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  39.58 
 
 
346 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  41.69 
 
 
337 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
337 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  39.88 
 
 
337 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  37.65 
 
 
357 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  36.9 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.89 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 
334 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.4 
 
 
694 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  28 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  24 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  25.7 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  28 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  23.62 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  26.19 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  24.9 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  26.89 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  27.65 
 
 
328 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  26.8 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  25.6 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  30.04 
 
 
695 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.73 
 
 
700 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  29.3 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  27.42 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  26.91 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  26.94 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  26.94 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  28.52 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  25.3 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  24.36 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  26.77 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.78 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  25.78 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  23.39 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.08 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.78 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  25.78 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.78 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.78 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.92 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.78 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.25 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.25 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>