164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0441 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 337 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  81.01 
 
 		 337 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  46.45 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  46.27 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  44.12 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  45.67 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  45.67 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  41.76 
 
 		 341 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  37.98 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  41.69 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  37.43 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  37.43 
 
 		 344 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  37.76 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  26.33 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  26.4 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  30.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  30.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  30.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  30.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  30.9 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.38 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  22.53 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  28.92 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.51 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  22.14 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.01 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.52 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.11 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.52 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.52 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.63 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.63 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.35 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  28.35 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  26.74 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.35 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.35 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  28.52 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.85 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  28.14 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  26.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  26.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  29.33 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  26.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  26.77 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.12 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  25 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  25.71 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  25.51 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  23.97 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  24.6 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>