198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15840 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
341 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  44.04 
 
 
342 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  42.65 
 
 
344 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  42.65 
 
 
344 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  43.24 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  42.22 
 
 
339 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  41.54 
 
 
339 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
342 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  40.77 
 
 
342 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  43.2 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  41.76 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  41.76 
 
 
337 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  40.65 
 
 
357 aa  255  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  40.18 
 
 
342 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  40.18 
 
 
342 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
342 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  33.43 
 
 
343 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.71 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  24.41 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  27.61 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  23.72 
 
 
314 aa  89.7  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  23.72 
 
 
314 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  23.72 
 
 
314 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  24.02 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
315 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  27.99 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  27.99 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  26.1 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  26.1 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  26.1 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  26.1 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  26.1 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  25.59 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.86 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.79 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.95 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.79 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  26.22 
 
 
694 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  23.44 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  25.1 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  26.06 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.27 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  26.99 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  23.46 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  27.31 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  23.99 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.9 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  24.8 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  24.85 
 
 
700 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  32.61 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  24.81 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  32.61 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  32.61 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  26.59 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  32.61 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  25.3 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  23.02 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  24.81 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  22.81 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  22.81 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  24.62 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  23.44 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  22.81 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  23.68 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  22.62 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  24.22 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>