94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0848 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  97.36 
 
 		 1022 aa  2033    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1022 aa  2104    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  36.52 
 
 		 1044 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  35.41 
 
 		 1044 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  35.4 
 
 		 1044 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  34.6 
 
 		 1005 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  32.17 
 
 		 1062 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  35.15 
 
 		 1037 aa  568  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  36.77 
 
 		 1061 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  38.53 
 
 		 1057 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  32.7 
 
 		 1009 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 		 1008 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 1022 aa  552  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 1043 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  34.08 
 
 		 1062 aa  542  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  32.99 
 
 		 1022 aa  542  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  32.46 
 
 		 1076 aa  536  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  32.95 
 
 		 1003 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  32.48 
 
 		 1020 aa  532  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  37.35 
 
 		 1055 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  33.05 
 
 		 1095 aa  523  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  31.92 
 
 		 1004 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  33.3 
 
 		 1147 aa  520  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  32.98 
 
 		 1063 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  31.8 
 
 		 1235 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  34.95 
 
 		 1032 aa  511  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  31.5 
 
 		 1002 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  33.52 
 
 		 1042 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  34.04 
 
 		 870 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  31.09 
 
 		 1032 aa  476  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  31.44 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  37.55 
 
 		 1007 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  34.3 
 
 		 1040 aa  462  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  30.83 
 
 		 1039 aa  459  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  36 
 
 		 1008 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  32.58 
 
 		 1049 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  32.14 
 
 		 1008 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 		 1010 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  29.94 
 
 		 1044 aa  445  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 1010 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 1058 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  32.16 
 
 		 1025 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  30.73 
 
 		 1113 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  32.1 
 
 		 1059 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  32.91 
 
 		 1034 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  32.87 
 
 		 1034 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 		 988 aa  412  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  32 
 
 		 1020 aa  409  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  30.69 
 
 		 1028 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  32.13 
 
 		 958 aa  402  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 		 1032 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  33.63 
 
 		 976 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  31.05 
 
 		 1048 aa  363  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  36.17 
 
 		 1048 aa  322  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  28.55 
 
 		 820 aa  319  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24641  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 1004 aa  292  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  40.25 
 
 		 1095 aa  292  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  27.48 
 
 		 1147 aa  277  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  27.31 
 
 		 979 aa  275  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0261  alpha mannosidase  28.07 
 
 		 988 aa  274  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  24.19 
 
 		 711 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  22.73 
 
 		 873 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  23.85 
 
 		 873 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  22.38 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  22.38 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  22.38 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  22.37 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  22 
 
 		 877 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  21.81 
 
 		 1408 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  20.94 
 
 		 1398 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.18 
 
 		 830 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  20.94 
 
 		 1398 aa  94.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  25.84 
 
 		 894 aa  93.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  22.15 
 
 		 1054 aa  92.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  25.66 
 
 		 878 aa  90.1  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  22.29 
 
 		 1465 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  24.59 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 937 aa  84.7  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1102  Alpha-mannosidase-like protein  30.2 
 
 		 151 aa  84  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.953361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  27.57 
 
 		 896 aa  82  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  24.3 
 
 		 1398 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 1374 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 1374 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 		 1378 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  29 
 
 		 900 aa  68.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 1368 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  19.6 
 
 		 1371 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  29.12 
 
 		 1002 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 832 aa  55.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  20.84 
 
 		 873 aa  54.7  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  24.29 
 
 		 831 aa  54.7  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 832 aa  53.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  24.64 
 
 		 969 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 897 aa  45.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>