34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2421 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  100 
 
 		 969 aa  2009    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  25.24 
 
 		 1168 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0602  glycosyl hydrolase 38 protein  26.18 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2436  glycoside hydrolase family 38  29.07 
 
 		 855 aa  159  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.114769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5024  glycoside hydrolase family 38  25.26 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431975  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  24.04 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.24 
 
 		 1037 aa  58.9  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  21.46 
 
 		 1371 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  23.43 
 
 		 1465 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  23.24 
 
 		 1408 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  23.7 
 
 		 1063 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  22.89 
 
 		 1076 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  21.34 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  21.36 
 
 		 1398 aa  55.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  20.79 
 
 		 1378 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  21.55 
 
 		 1044 aa  54.3  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.29 
 
 		 1049 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  22.77 
 
 		 1095 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  23.3 
 
 		 1398 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  20.26 
 
 		 1042 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  21.72 
 
 		 1058 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  18.74 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2926  hypothetical protein  26.18 
 
 		 641 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  20.5 
 
 		 1032 aa  51.6  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  23.35 
 
 		 1147 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  20.52 
 
 		 1010 aa  50.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  18.18 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.36 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  21.2 
 
 		 1398 aa  48.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  24.64 
 
 		 1022 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  32.41 
 
 		 1235 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  23.57 
 
 		 1022 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  32.5 
 
 		 1007 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  20.09 
 
 		 1025 aa  45.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>