88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1084 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  77.27 
 
 
1408 aa  2172    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  49.17 
 
 
1398 aa  1225    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  93.49 
 
 
1398 aa  2620    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  48.75 
 
 
1378 aa  1203    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  50.56 
 
 
1368 aa  1262    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1398 aa  2796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
1371 aa  1226    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  50.42 
 
 
1374 aa  1273    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  54.3 
 
 
1465 aa  1407    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  50.42 
 
 
1374 aa  1273    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  22.74 
 
 
1044 aa  154  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  22.87 
 
 
1040 aa  147  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  24.96 
 
 
1059 aa  144  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  25.21 
 
 
1061 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 
1058 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  22.83 
 
 
1034 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.99 
 
 
1034 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  22.89 
 
 
1095 aa  129  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  20.95 
 
 
873 aa  127  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 
1043 aa  125  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  25.66 
 
 
1055 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.24 
 
 
1049 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  25.3 
 
 
1025 aa  118  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  23.77 
 
 
1057 aa  117  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  23.61 
 
 
877 aa  115  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  23.64 
 
 
873 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  25.54 
 
 
1076 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  22.24 
 
 
1022 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  23.77 
 
 
877 aa  109  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  23.77 
 
 
877 aa  109  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  23.77 
 
 
877 aa  109  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  23.77 
 
 
877 aa  109  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  22.03 
 
 
870 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 
937 aa  107  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  21.91 
 
 
859 aa  105  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  22.72 
 
 
1044 aa  104  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  22.19 
 
 
1044 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  22.91 
 
 
1022 aa  102  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  23.67 
 
 
1147 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  25.09 
 
 
1054 aa  99  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  19.91 
 
 
1022 aa  94.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  22.94 
 
 
820 aa  94.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  21.37 
 
 
1095 aa  93.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  25.99 
 
 
1235 aa  90.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  25.63 
 
 
1062 aa  90.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.42 
 
 
1037 aa  87.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  26.37 
 
 
1147 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  20.06 
 
 
1022 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.1 
 
 
830 aa  83.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  26.37 
 
 
900 aa  83.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  21.76 
 
 
1010 aa  83.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  25.55 
 
 
1063 aa  81.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  21.16 
 
 
878 aa  80.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  24.93 
 
 
1039 aa  80.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  22.19 
 
 
1113 aa  80.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  21.96 
 
 
1010 aa  80.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  22.89 
 
 
1048 aa  79.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
1008 aa  79  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  24.85 
 
 
1046 aa  78.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  20.34 
 
 
894 aa  77.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  25.59 
 
 
1168 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  22.51 
 
 
873 aa  76.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  23.26 
 
 
1009 aa  75.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  22.92 
 
 
958 aa  74.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  20.04 
 
 
1032 aa  72  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  19.52 
 
 
896 aa  71.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  20.54 
 
 
1048 aa  69.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  22.48 
 
 
1005 aa  68.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  24.24 
 
 
711 aa  68.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  22.77 
 
 
1062 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  21.97 
 
 
1028 aa  66.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0602  glycosyl hydrolase 38 protein  26.06 
 
 
856 aa  64.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  21.77 
 
 
1002 aa  61.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  22.15 
 
 
1032 aa  60.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  20.62 
 
 
1044 aa  59.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  23.6 
 
 
1003 aa  58.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  26.6 
 
 
976 aa  58.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  23.58 
 
 
1032 aa  57.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  21.73 
 
 
1004 aa  57  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  23.86 
 
 
1002 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  25.46 
 
 
1042 aa  55.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  22.55 
 
 
1007 aa  54.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  35.8 
 
 
1020 aa  53.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  24.04 
 
 
1008 aa  52.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  24.04 
 
 
1008 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.86 
 
 
969 aa  49.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  26.21 
 
 
1020 aa  48.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  28.35 
 
 
831 aa  47.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>