19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0602 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0602  glycosyl hydrolase 38 protein  100 
 
 		 856 aa  1746    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  27.48 
 
 		 1168 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  26.18 
 
 		 969 aa  243  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2436  glycoside hydrolase family 38  24.19 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.114769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5024  glycoside hydrolase family 38  25.88 
 
 		 802 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431975  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 1398 aa  66.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 1398 aa  65.1  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 1058 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  20.29 
 
 		 820 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  25.93 
 
 		 1408 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  22.96 
 
 		 1371 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  21.93 
 
 		 1378 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  20.79 
 
 		 878 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  21.43 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2926  hypothetical protein  25.4 
 
 		 641 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  22.99 
 
 		 1465 aa  47.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  23.28 
 
 		 1398 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 1374 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 1374 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>