90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1249 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  65.52 
 
 
1368 aa  1748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  50.1 
 
 
1408 aa  1223    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  47 
 
 
1465 aa  1142    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1371 aa  2754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  66.21 
 
 
1374 aa  1788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  76.4 
 
 
1378 aa  2119    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  66.21 
 
 
1374 aa  1788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 
1398 aa  1210    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
1398 aa  1216    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  64.07 
 
 
1398 aa  1689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  21.56 
 
 
1044 aa  128  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 
1058 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  23.5 
 
 
1061 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  23.09 
 
 
1057 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  25.09 
 
 
1059 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  21.08 
 
 
1040 aa  110  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.31 
 
 
1049 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  22.39 
 
 
877 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  20.68 
 
 
1043 aa  99.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  22.39 
 
 
877 aa  99  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  22.39 
 
 
877 aa  99  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  22.39 
 
 
877 aa  99  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  22.39 
 
 
877 aa  99  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
937 aa  99  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  20.07 
 
 
873 aa  98.6  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  23.4 
 
 
1025 aa  97.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  22.84 
 
 
1095 aa  96.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  20.86 
 
 
859 aa  94.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  22.38 
 
 
820 aa  93.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  22.85 
 
 
873 aa  92.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  23.68 
 
 
1055 aa  90.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  26.79 
 
 
1235 aa  89.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 
1008 aa  87  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  21.55 
 
 
1034 aa  85.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.18 
 
 
1037 aa  85.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  21.33 
 
 
1095 aa  83.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  23.08 
 
 
1076 aa  83.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  21.37 
 
 
1022 aa  83.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  21.43 
 
 
878 aa  81.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.78 
 
 
1034 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  21.75 
 
 
1044 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  22.8 
 
 
1054 aa  80.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  22.03 
 
 
1044 aa  78.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  20.87 
 
 
894 aa  77.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  22.24 
 
 
873 aa  76.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  22.91 
 
 
1046 aa  75.1  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  23.81 
 
 
1062 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  21.87 
 
 
1039 aa  73.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  22.37 
 
 
1147 aa  71.6  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  22.52 
 
 
958 aa  71.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  25.76 
 
 
1004 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  22.22 
 
 
1009 aa  70.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  22.48 
 
 
1005 aa  68.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  24.19 
 
 
900 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  23.44 
 
 
1028 aa  67.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  26.29 
 
 
1113 aa  66.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  24.74 
 
 
830 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  22.75 
 
 
1044 aa  65.1  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  19.44 
 
 
1022 aa  64.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  23.73 
 
 
1168 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  21.57 
 
 
1022 aa  62.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  28.97 
 
 
870 aa  62  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  22.8 
 
 
1002 aa  61.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  30 
 
 
1048 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  23.58 
 
 
1003 aa  61.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  21.28 
 
 
1022 aa  58.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  23.08 
 
 
1008 aa  58.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  28.4 
 
 
831 aa  57.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  24.04 
 
 
1147 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  19.82 
 
 
1010 aa  57  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  18.66 
 
 
896 aa  57  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  25.7 
 
 
711 aa  56.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  28 
 
 
1042 aa  56.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  32 
 
 
1020 aa  55.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  19.4 
 
 
1010 aa  55.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  20.6 
 
 
1048 aa  55.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  21.79 
 
 
1008 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  22.51 
 
 
1032 aa  55.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.76 
 
 
969 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  31.73 
 
 
1062 aa  53.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
988 aa  53.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
832 aa  53.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0602  glycosyl hydrolase 38 protein  22.96 
 
 
856 aa  52.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  25.47 
 
 
1020 aa  52  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  26.32 
 
 
1063 aa  52  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
832 aa  52  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52248  alpha mannosidase  25.81 
 
 
173 aa  48.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  24.24 
 
 
1002 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  22.01 
 
 
1007 aa  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5024  glycoside hydrolase family 38  25.35 
 
 
802 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431975  normal  0.761562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>