89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1191 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  49.93 
 
 		 1374 aa  1255    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  76.92 
 
 		 1408 aa  2170    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 		 1371 aa  1210    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  93.49 
 
 		 1398 aa  2601    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  48.61 
 
 		 1398 aa  1219    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1398 aa  2793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  49.93 
 
 		 1374 aa  1255    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  48.27 
 
 		 1378 aa  1184    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  54.46 
 
 		 1465 aa  1414    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  50.52 
 
 		 1368 aa  1244    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  22.92 
 
 		 1044 aa  153  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  25.91 
 
 		 1059 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  23.86 
 
 		 1040 aa  145  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  23.1 
 
 		 1034 aa  141  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 1058 aa  138  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  24.55 
 
 		 1061 aa  135  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  23.14 
 
 		 1095 aa  135  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.06 
 
 		 1034 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.41 
 
 		 1049 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  20.45 
 
 		 873 aa  120  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  26.09 
 
 		 1055 aa  118  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  24 
 
 		 1057 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 1043 aa  115  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  22.92 
 
 		 873 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  25.84 
 
 		 1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  24.01 
 
 		 877 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  25.57 
 
 		 1076 aa  113  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  23.16 
 
 		 859 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 937 aa  111  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  24.33 
 
 		 877 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  24.33 
 
 		 877 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  24.33 
 
 		 877 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  24.33 
 
 		 877 aa  110  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  22 
 
 		 1022 aa  108  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  22.59 
 
 		 870 aa  104  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  22.45 
 
 		 1044 aa  103  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  23.46 
 
 		 820 aa  102  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  21.93 
 
 		 1044 aa  102  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  22.79 
 
 		 1022 aa  100  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  22.89 
 
 		 1048 aa  100  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  26.43 
 
 		 1235 aa  98.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  20.14 
 
 		 1022 aa  96.3  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  24.46 
 
 		 1054 aa  96.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  27.55 
 
 		 900 aa  92  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  20.95 
 
 		 1095 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  25.68 
 
 		 1062 aa  90.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  22.22 
 
 		 1147 aa  89.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.85 
 
 		 1037 aa  89.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  19.86 
 
 		 1022 aa  88.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  34.25 
 
 		 1147 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  25.44 
 
 		 1046 aa  84  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  23.36 
 
 		 873 aa  83.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  24.93 
 
 		 1039 aa  82.4  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  21.42 
 
 		 1113 aa  81.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  25.14 
 
 		 1063 aa  80.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  20.73 
 
 		 894 aa  77.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  23.51 
 
 		 958 aa  78.2  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  23.35 
 
 		 1009 aa  76.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 1008 aa  76.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  21.24 
 
 		 878 aa  75.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  23.17 
 
 		 1062 aa  75.5  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.62 
 
 		 830 aa  75.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  20.03 
 
 		 1010 aa  75.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  19.6 
 
 		 896 aa  74.3  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  25.32 
 
 		 1168 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  23.7 
 
 		 1005 aa  70.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  24.78 
 
 		 1042 aa  70.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  20.5 
 
 		 1032 aa  70.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  20.21 
 
 		 1010 aa  69.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  23.53 
 
 		 711 aa  67.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  23.2 
 
 		 1028 aa  67  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  21.09 
 
 		 1048 aa  66.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0602  glycosyl hydrolase 38 protein  26.61 
 
 		 856 aa  66.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  21.14 
 
 		 1044 aa  65.9  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  24.22 
 
 		 1002 aa  63.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  23.6 
 
 		 1003 aa  61.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  24.62 
 
 		 1002 aa  59.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  21.2 
 
 		 1004 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2421  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.36 
 
 		 969 aa  55.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.433161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  22.69 
 
 		 1032 aa  55.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  23.62 
 
 		 1007 aa  55.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  25 
 
 		 976 aa  54.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  24.04 
 
 		 1008 aa  52.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  34.57 
 
 		 1020 aa  52  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  24.04 
 
 		 1008 aa  50.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  29.13 
 
 		 831 aa  50.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  24.84 
 
 		 1020 aa  50.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  31.25 
 
 		 686 aa  47  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 988 aa  45.8  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>