93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5578 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  100 
 
 		 1022 aa  2107    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  35.31 
 
 		 1044 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  37.78 
 
 		 1044 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  37.84 
 
 		 1044 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 1043 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  37.47 
 
 		 1057 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 1022 aa  594  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  37.4 
 
 		 1061 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  37.57 
 
 		 1055 aa  589  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  36.78 
 
 		 1037 aa  571  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  33.36 
 
 		 1022 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 		 1022 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  35.38 
 
 		 1042 aa  529  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  33.86 
 
 		 1005 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  33.72 
 
 		 1062 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  30.6 
 
 		 870 aa  509  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  33.59 
 
 		 1062 aa  500  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 		 1008 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  33.53 
 
 		 1009 aa  489  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  37.98 
 
 		 1008 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  35.78 
 
 		 1076 aa  489  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  36.28 
 
 		 1235 aa  486  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  38.35 
 
 		 1008 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  36.3 
 
 		 1063 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  29.76 
 
 		 1048 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  36.96 
 
 		 1007 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  31.75 
 
 		 1020 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  36.14 
 
 		 1028 aa  436  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 1010 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  33 
 
 		 1002 aa  429  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  34.62 
 
 		 1059 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  29.22 
 
 		 1034 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  30.64 
 
 		 1004 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  35.17 
 
 		 1003 aa  422  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  33.29 
 
 		 1010 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  32.45 
 
 		 1025 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  32.89 
 
 		 1032 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  33.12 
 
 		 1095 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.66 
 
 		 1034 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  30.76 
 
 		 1046 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  32.21 
 
 		 1020 aa  403  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  31.83 
 
 		 1040 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  34.79 
 
 		 1147 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.69 
 
 		 1049 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 		 988 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  30.47 
 
 		 1044 aa  396  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 1032 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  32.93 
 
 		 1039 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  32.51 
 
 		 1032 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  33.59 
 
 		 976 aa  380  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  29.96 
 
 		 958 aa  366  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  31.9 
 
 		 1113 aa  360  8e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  29.64 
 
 		 1048 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  27.61 
 
 		 1147 aa  268  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  29.29 
 
 		 1095 aa  264  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24641  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 1004 aa  254  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 		 1058 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0261  alpha mannosidase  29.56 
 
 		 988 aa  249  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  27.36 
 
 		 979 aa  249  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  31.37 
 
 		 820 aa  174  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  26.51 
 
 		 711 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  20.34 
 
 		 859 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  22.94 
 
 		 1054 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  21.39 
 
 		 873 aa  108  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 1398 aa  101  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 1398 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 1374 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 1374 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 		 1378 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  26.95 
 
 		 873 aa  89  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  23.75 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  23.68 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  23.68 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  23.68 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 		 1368 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  24.25 
 
 		 1398 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  25.58 
 
 		 1465 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  23.02 
 
 		 1408 aa  84.7  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  21.69 
 
 		 1371 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 937 aa  84.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  23.13 
 
 		 877 aa  83.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.9 
 
 		 896 aa  81.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  22.86 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  31.07 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  31.95 
 
 		 894 aa  72  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1102  Alpha-mannosidase-like protein  30.26 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.953361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  26.09 
 
 		 831 aa  58.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  25.71 
 
 		 1002 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 832 aa  54.7  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 832 aa  54.3  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  21.35 
 
 		 897 aa  53.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  28.37 
 
 		 1168 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  19.74 
 
 		 873 aa  45.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>