92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1405 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  100 
 
 
859 aa  1764    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  37.92 
 
 
873 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
937 aa  462  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  32.45 
 
 
1054 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  32.72 
 
 
894 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  29.63 
 
 
873 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  30.97 
 
 
873 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  28 
 
 
877 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  27.77 
 
 
877 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  28.11 
 
 
877 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  28 
 
 
877 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  28 
 
 
877 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  28.11 
 
 
878 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.43 
 
 
896 aa  340  7e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  30.43 
 
 
900 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  26.43 
 
 
1048 aa  188  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  25.77 
 
 
1044 aa  177  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 
1022 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
897 aa  167  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  22.69 
 
 
1057 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  41.99 
 
 
1002 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.64 
 
 
1037 aa  160  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  21.56 
 
 
1061 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 
832 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 
832 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  22.95 
 
 
1044 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  22.61 
 
 
1044 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  23.54 
 
 
1076 aa  141  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.64 
 
 
1059 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  22.21 
 
 
1062 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 
1043 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  21.87 
 
 
976 aa  135  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  23.42 
 
 
820 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.71 
 
 
1034 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  22.7 
 
 
1032 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  21.42 
 
 
1025 aa  127  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  22.72 
 
 
1034 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  22.47 
 
 
1040 aa  125  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 
1058 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  22.29 
 
 
1063 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  23.49 
 
 
870 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.57 
 
 
1049 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  22.06 
 
 
1147 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 
1010 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  20.02 
 
 
1022 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
1398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  24.51 
 
 
416 aa  107  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  21.14 
 
 
1095 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 
1010 aa  106  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  21.85 
 
 
1048 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
1398 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  24.81 
 
 
1465 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  23.94 
 
 
1408 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  20.86 
 
 
1055 aa  95.9  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  21.49 
 
 
1028 aa  95.5  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
1032 aa  94.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  20.86 
 
 
1371 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  20.96 
 
 
1374 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  20.96 
 
 
1374 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  20.93 
 
 
1062 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  21.75 
 
 
1398 aa  92  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
988 aa  90.9  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  24.93 
 
 
1022 aa  89  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  21.71 
 
 
1378 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  21.59 
 
 
1147 aa  86.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  24.59 
 
 
1022 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  23.21 
 
 
1046 aa  84.3  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  25.56 
 
 
1039 aa  84.3  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  21.84 
 
 
1007 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  20.87 
 
 
1235 aa  76.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  23.93 
 
 
1008 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  24.07 
 
 
1044 aa  74.7  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 
1368 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  21.49 
 
 
1008 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  25 
 
 
1020 aa  73.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  23.18 
 
 
1003 aa  71.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  22.91 
 
 
1002 aa  67.8  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  22.98 
 
 
1005 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  23.05 
 
 
1042 aa  65.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  22.65 
 
 
1113 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  22.37 
 
 
1004 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  20.71 
 
 
1168 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  22.56 
 
 
711 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  21.76 
 
 
1008 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  25.52 
 
 
1095 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  24.59 
 
 
1020 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  27.47 
 
 
958 aa  55.1  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  24.06 
 
 
1032 aa  52.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1102  Alpha-mannosidase-like protein  22.56 
 
 
151 aa  52  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.953361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  23.44 
 
 
831 aa  52  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  25 
 
 
1009 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  19.64 
 
 
979 aa  44.7  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>