86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1715 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  100 
 
 
1002 aa  1981    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  47.64 
 
 
900 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 
937 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  42.79 
 
 
873 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  40.3 
 
 
873 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  37.55 
 
 
894 aa  171  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  41.99 
 
 
859 aa  161  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  31.34 
 
 
873 aa  156  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  37.81 
 
 
877 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  37.81 
 
 
877 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  37.81 
 
 
877 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  37.81 
 
 
877 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  37.81 
 
 
877 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  39.88 
 
 
896 aa  149  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  29.19 
 
 
878 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  34.38 
 
 
1054 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
832 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 
832 aa  126  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 
897 aa  112  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  25 
 
 
416 aa  77.4  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  28.44 
 
 
1005 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  31.49 
 
 
1113 aa  73.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  29.03 
 
 
1046 aa  73.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  30.96 
 
 
831 aa  72  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  29.94 
 
 
820 aa  69.3  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  28.96 
 
 
1039 aa  69.3  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  30.04 
 
 
1235 aa  68.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  30.65 
 
 
1008 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  30.16 
 
 
1044 aa  66.6  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  34.13 
 
 
1025 aa  66.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
1008 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  32.78 
 
 
1062 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  29.89 
 
 
1003 aa  65.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  26.85 
 
 
1020 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  30.11 
 
 
1008 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  28.73 
 
 
958 aa  63.9  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  29.12 
 
 
1022 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  29.83 
 
 
1147 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  29.83 
 
 
1022 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  28.42 
 
 
1009 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  32.93 
 
 
1062 aa  62.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  27.78 
 
 
1095 aa  62.4  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  38.46 
 
 
1049 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  26.09 
 
 
1044 aa  62  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  31.02 
 
 
1048 aa  62  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  30.68 
 
 
1061 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  36.29 
 
 
1059 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  28.49 
 
 
1004 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  28.11 
 
 
1032 aa  60.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  34.09 
 
 
1034 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  25 
 
 
1408 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
1022 aa  60.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
1043 aa  59.3  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 
1398 aa  59.3  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
1032 aa  59.3  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  34.51 
 
 
1095 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  28.65 
 
 
1076 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  29.35 
 
 
1002 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  26.56 
 
 
1007 aa  57  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  27.62 
 
 
1048 aa  56.2  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.89 
 
 
1037 aa  56.2  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  35.58 
 
 
1034 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
1374 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
1374 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  28.21 
 
 
1465 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
1058 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
1368 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  27.67 
 
 
1020 aa  55.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  27.91 
 
 
1044 aa  54.7  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  27.91 
 
 
1044 aa  54.7  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  25.71 
 
 
1022 aa  54.7  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  27.59 
 
 
1028 aa  54.7  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  30.08 
 
 
1057 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  28.57 
 
 
976 aa  54.7  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
1398 aa  54.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  33.93 
 
 
1055 aa  51.2  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  25.38 
 
 
1398 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  28.25 
 
 
1040 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
1010 aa  50.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 
1378 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  26.76 
 
 
979 aa  48.9  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  30.36 
 
 
870 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
1371 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 
1010 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  36.44 
 
 
2570 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
988 aa  45.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>