79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3715 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  100 
 
 		 831 aa  1661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  28.25 
 
 		 1025 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  30.96 
 
 		 1002 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.57 
 
 		 1049 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  29.71 
 
 		 1048 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  34.08 
 
 		 900 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  27.12 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.46 
 
 		 1059 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 1058 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  24.12 
 
 		 1044 aa  65.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  26.37 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  31.71 
 
 		 1465 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 1022 aa  63.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 1378 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  26.95 
 
 		 1046 aa  62.4  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  30.49 
 
 		 1398 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  25.87 
 
 		 1008 aa  61.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  26.32 
 
 		 1039 aa  60.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  24.02 
 
 		 1037 aa  60.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  25.87 
 
 		 1008 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 937 aa  60.1  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  25.79 
 
 		 1055 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  22.6 
 
 		 1043 aa  58.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 1032 aa  58.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  26.09 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  26.9 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  25.5 
 
 		 958 aa  57.8  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 1371 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  24.86 
 
 		 1022 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  22.6 
 
 		 1040 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  29.14 
 
 		 1062 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  24.83 
 
 		 1095 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  25.49 
 
 		 1028 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 1374 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 1374 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  24.43 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  26.46 
 
 		 873 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 1368 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  26.14 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  24.29 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  24.39 
 
 		 1044 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  23.43 
 
 		 1034 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  25.17 
 
 		 1007 aa  53.5  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  24.72 
 
 		 1044 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  24.72 
 
 		 1044 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  23.44 
 
 		 859 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  26.7 
 
 		 1020 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  23.72 
 
 		 1003 aa  52  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  22.44 
 
 		 1005 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  27.23 
 
 		 873 aa  51.2  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  24.28 
 
 		 976 aa  50.8  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 1398 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 1010 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  23.98 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  23.98 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  23.98 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  25.93 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  23.98 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  23.98 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  29.13 
 
 		 1408 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 1010 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  22.38 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  24.55 
 
 		 1020 aa  48.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  22.07 
 
 		 711 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  21.68 
 
 		 1009 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 1398 aa  47.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  23.25 
 
 		 894 aa  47.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  23.53 
 
 		 1113 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  22.64 
 
 		 1235 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  25.32 
 
 		 1057 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  25.81 
 
 		 1032 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  19.08 
 
 		 988 aa  45.8  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  27.5 
 
 		 1147 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  23.56 
 
 		 878 aa  45.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  25.36 
 
 		 873 aa  45.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  21.15 
 
 		 1061 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  29.29 
 
 		 896 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  32.93 
 
 		 1042 aa  44.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  23.6 
 
 		 1004 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>