94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1720 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  42.16 
 
 
1044 aa  748    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  36.26 
 
 
1061 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  36.49 
 
 
1057 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1043 aa  2169    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 
1022 aa  790    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  42.56 
 
 
1044 aa  801    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  40.7 
 
 
1044 aa  753    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  49.24 
 
 
1037 aa  986    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  34.97 
 
 
1055 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  35.29 
 
 
1022 aa  605  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  36.12 
 
 
1048 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  33.65 
 
 
1042 aa  572  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  33.95 
 
 
1022 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  33.88 
 
 
1022 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  35.17 
 
 
870 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  35.26 
 
 
1063 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  31.07 
 
 
1076 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  31.48 
 
 
1008 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  34.73 
 
 
1062 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 
1010 aa  479  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 
1010 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  30.32 
 
 
1062 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  31.16 
 
 
1008 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  30.38 
 
 
1007 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  32.15 
 
 
1032 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 
988 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  33.82 
 
 
1147 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  32.42 
 
 
1020 aa  452  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  33.46 
 
 
1009 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  31.57 
 
 
1034 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
1058 aa  436  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  31.76 
 
 
976 aa  431  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  31.2 
 
 
1034 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  32.01 
 
 
1028 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  29.2 
 
 
1235 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  31.38 
 
 
1040 aa  429  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 
1008 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  30.76 
 
 
1025 aa  426  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  31.48 
 
 
1095 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.47 
 
 
1059 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  30.15 
 
 
1004 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  35.46 
 
 
1095 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  28.82 
 
 
1020 aa  419  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  30.66 
 
 
1049 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  30.03 
 
 
1002 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 
1032 aa  398  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  31.26 
 
 
1113 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  30.85 
 
 
1046 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  30.02 
 
 
1044 aa  363  1e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  28.08 
 
 
1039 aa  352  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  27.13 
 
 
958 aa  335  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  29.33 
 
 
820 aa  327  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  28.91 
 
 
1048 aa  325  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  28 
 
 
1147 aa  281  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  32.48 
 
 
1032 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  31.3 
 
 
1005 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24641  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 
1004 aa  261  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  29.85 
 
 
1003 aa  248  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  25.14 
 
 
979 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0261  alpha mannosidase  25.8 
 
 
988 aa  231  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  24.16 
 
 
1054 aa  139  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  23.69 
 
 
859 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  23.97 
 
 
873 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 
937 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
1398 aa  125  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  26.33 
 
 
711 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 
1398 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  22.74 
 
 
873 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  22.82 
 
 
894 aa  107  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.28 
 
 
896 aa  101  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  20.78 
 
 
1371 aa  100  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  21.1 
 
 
1374 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  21.1 
 
 
1374 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  22.21 
 
 
1398 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  20.99 
 
 
877 aa  92  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  21.32 
 
 
1408 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  21.15 
 
 
878 aa  91.3  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  21.98 
 
 
1465 aa  88.6  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  20.7 
 
 
1368 aa  88.6  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  20.99 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  20.99 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  20.99 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  20.99 
 
 
877 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  19.71 
 
 
1378 aa  85.1  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  23.68 
 
 
900 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1102  Alpha-mannosidase-like protein  28.48 
 
 
151 aa  78.2  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.953361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.03 
 
 
830 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  29.95 
 
 
1002 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  22.6 
 
 
831 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 
832 aa  57  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 
897 aa  55.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  21.6 
 
 
873 aa  55.8  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
832 aa  55.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  21.21 
 
 
1168 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>