80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1587 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 832 aa  1689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  99.28 
 
 		 832 aa  1675    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 897 aa  330  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  29.95 
 
 		 1054 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  32 
 
 		 873 aa  178  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 		 937 aa  164  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  32.3 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  32.3 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  32.3 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  32.3 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  32.3 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  29.27 
 
 		 900 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  29.43 
 
 		 873 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  25.3 
 
 		 859 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  26.67 
 
 		 878 aa  140  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  27.93 
 
 		 894 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.95 
 
 		 896 aa  129  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  33.8 
 
 		 1002 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  26.43 
 
 		 873 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 1010 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  26.11 
 
 		 1020 aa  72.8  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 988 aa  71.2  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 1010 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  30.13 
 
 		 1113 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  24.87 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  25.45 
 
 		 1062 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 1022 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  24.49 
 
 		 1044 aa  65.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  29.48 
 
 		 1235 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  26.32 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  29.7 
 
 		 1009 aa  64.7  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  28.32 
 
 		 1003 aa  64.3  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  26.73 
 
 		 1039 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  28.25 
 
 		 870 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 1008 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  28.65 
 
 		 1046 aa  62  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 1032 aa  61.2  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  29.27 
 
 		 1062 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  22.73 
 
 		 1048 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  23.08 
 
 		 1055 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  25.29 
 
 		 1028 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  26.29 
 
 		 958 aa  58.9  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  25.58 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  22.72 
 
 		 1004 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  27.22 
 
 		 1048 aa  58.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  25.88 
 
 		 1095 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  27.91 
 
 		 1002 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  22.99 
 
 		 1076 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  24.71 
 
 		 1044 aa  55.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  25.73 
 
 		 976 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  27.75 
 
 		 1034 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  27.91 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  25.57 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  27.71 
 
 		 1008 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  26.32 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  21.99 
 
 		 820 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 		 1043 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  25.91 
 
 		 1044 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  28.25 
 
 		 1063 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  29.34 
 
 		 1059 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  25.91 
 
 		 1044 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  28.07 
 
 		 1147 aa  52.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 1058 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 1371 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  26.51 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  23.03 
 
 		 711 aa  50.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  26.55 
 
 		 1007 aa  50.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  26.74 
 
 		 1057 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  25.86 
 
 		 1040 aa  50.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.57 
 
 		 1034 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  26.16 
 
 		 1032 aa  48.5  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  22.63 
 
 		 1032 aa  48.5  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  22.86 
 
 		 1398 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 1374 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 1374 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  25.37 
 
 		 1095 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 1368 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  22.06 
 
 		 1408 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 1378 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>