90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10940  alpha-mannosidase  100 
 
 
1032 aa  2102    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00976973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 
1008 aa  972    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2999  glycoside hydrolase family 38  50.53 
 
 
1235 aa  935    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  37.19 
 
 
1046 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  43.44 
 
 
1002 aa  729    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  51.64 
 
 
1009 aa  983    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2258  Alpha-mannosidase  45.48 
 
 
1020 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5005  MAN2C1 protein-like protein  47.25 
 
 
1004 aa  859    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457974  normal  0.47837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  41.79 
 
 
1003 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2861  glycoside hydrolase family 38  47.4 
 
 
1005 aa  849    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.985945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1595  glycoside hydrolase family 38  45.95 
 
 
1062 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503925  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  35.86 
 
 
1039 aa  594  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  33.4 
 
 
1044 aa  592  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  35.18 
 
 
958 aa  560  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  32.22 
 
 
1022 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  31.37 
 
 
1022 aa  479  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  33.12 
 
 
1095 aa  456  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  30.74 
 
 
1147 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  31.33 
 
 
1044 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  32.3 
 
 
1057 aa  446  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  32.12 
 
 
1061 aa  439  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  34.9 
 
 
1055 aa  432  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 
1022 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  33.26 
 
 
1076 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
1043 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  31.57 
 
 
1044 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  31.04 
 
 
1044 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5578  alpha-mannosidase  32.81 
 
 
1022 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  32.4 
 
 
1037 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  34.25 
 
 
1062 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  33.92 
 
 
1008 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  32.96 
 
 
1008 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  33.37 
 
 
1042 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  35.3 
 
 
1063 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  33.29 
 
 
1010 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  31.95 
 
 
1020 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 
988 aa  375  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 
1010 aa  376  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  27.16 
 
 
1113 aa  376  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  31.07 
 
 
1048 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  30.27 
 
 
870 aa  351  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  29.3 
 
 
1040 aa  350  6e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
1058 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  31.23 
 
 
1007 aa  343  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
1032 aa  340  8e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  28.36 
 
 
1034 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  30.66 
 
 
1025 aa  330  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.82 
 
 
1034 aa  327  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  32.53 
 
 
1028 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  29.35 
 
 
1032 aa  321  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  28.08 
 
 
1049 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  29.43 
 
 
976 aa  274  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  27.8 
 
 
1048 aa  270  8e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  34.84 
 
 
1059 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  34.31 
 
 
1095 aa  239  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  25.95 
 
 
1147 aa  208  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2083  alpha mannosidase  34.18 
 
 
979 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0261  alpha mannosidase  27.66 
 
 
988 aa  199  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24641  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 
1004 aa  198  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  30.03 
 
 
820 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2525  glycoside hydrolase family 38  31.18 
 
 
711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000592255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  23.77 
 
 
873 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 
937 aa  80.9  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  22.62 
 
 
877 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  22.62 
 
 
877 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  22.62 
 
 
877 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  22.62 
 
 
877 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  22.62 
 
 
877 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 
1368 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  23.56 
 
 
900 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  22.83 
 
 
873 aa  68.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  23.89 
 
 
1398 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  24.32 
 
 
1408 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 
1374 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 
1374 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  22.68 
 
 
878 aa  64.3  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 
1378 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  28.11 
 
 
1002 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.14 
 
 
896 aa  60.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  22.3 
 
 
830 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
1398 aa  58.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  22.02 
 
 
1398 aa  57.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 
1371 aa  57  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  23.27 
 
 
859 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 
832 aa  52.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  24.05 
 
 
1465 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  24.53 
 
 
1054 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
832 aa  48.9  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1102  Alpha-mannosidase-like protein  22.62 
 
 
151 aa  48.5  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.953361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  22.72 
 
 
897 aa  45.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>