71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0149 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0149  glycoside hydrolase family 38  100 
 
 
873 aa  1771    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1405  sugar hydrolase  37.92 
 
 
859 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.893687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2236  alpha-mannosidase  26.57 
 
 
873 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3591  glycoside hydrolase family 38  30.58 
 
 
873 aa  302  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0758  alpha-mannosidase  27.38 
 
 
877 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.915503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00691  alpha-mannosidase  27.28 
 
 
877 aa  283  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.477515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2924  alpha-mannosidase  27.28 
 
 
877 aa  283  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00680  hypothetical protein  27.28 
 
 
877 aa  283  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.613099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2904  glycoside hydrolase family 38  27.28 
 
 
877 aa  283  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0245738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0070  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 
937 aa  279  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1456  glycoside hydrolase family 38  28.7 
 
 
894 aa  273  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3244  glycoside hydrolase family 38  27.52 
 
 
878 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3955  glycosyl hydrolase 38 domain protein  27.66 
 
 
896 aa  238  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22970  alpha-mannosidase  26.89 
 
 
1054 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5878  Alpha-mannosidase-like protein  22.54 
 
 
900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167609  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1715  glycoside hydrolase family 38  32.32 
 
 
1002 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1489  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
897 aa  128  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1538  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
832 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00952426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1587  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 
832 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
1398 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  24.9 
 
 
1465 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  22.24 
 
 
1371 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 
1398 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  23.2 
 
 
820 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 
1378 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  22.91 
 
 
1408 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  23.14 
 
 
1398 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 
1058 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  25 
 
 
1048 aa  68.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  21.28 
 
 
1040 aa  68.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.88 
 
 
1037 aa  66.6  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  23.78 
 
 
1034 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.31 
 
 
1059 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 
1368 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  22.99 
 
 
1025 aa  62  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 
1010 aa  61.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 
1010 aa  61.2  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  29.32 
 
 
1034 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  20.6 
 
 
1044 aa  58.9  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  19.63 
 
 
1057 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  21.86 
 
 
1046 aa  55.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  24.02 
 
 
1032 aa  56.2  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  22.8 
 
 
1039 aa  56.2  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.57 
 
 
1049 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1289  Alpha-mannosidase  19.32 
 
 
976 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.891323  normal  0.0327923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  25 
 
 
416 aa  55.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  23.94 
 
 
1008 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  20.44 
 
 
1022 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0811  Alpha-mannosidase  23.67 
 
 
1020 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  21.33 
 
 
1043 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  21.89 
 
 
1044 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  22.86 
 
 
870 aa  53.5  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  18.89 
 
 
1061 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83621  Glycoside hydrolase, family 38 vacuolar alpha mannosidase  20.57 
 
 
1113 aa  52.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  23.68 
 
 
1007 aa  52  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  20.44 
 
 
1022 aa  51.6  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0104  Alpha-mannosidase  27.54 
 
 
1048 aa  51.2  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  23.12 
 
 
1008 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
1032 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  20.42 
 
 
1003 aa  49.3  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0644  glycosyl hydrolases 38-like  19.55 
 
 
1168 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.211348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  27.46 
 
 
1076 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  21.46 
 
 
1147 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  25.85 
 
 
1062 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  20.82 
 
 
1022 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  19.92 
 
 
1055 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3715  glycoside hydrolase family 38  25.36 
 
 
831 aa  45.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  25.71 
 
 
958 aa  45.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  19.82 
 
 
1095 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  19.7 
 
 
1063 aa  44.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  26.2 
 
 
1095 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>