236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01130 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01130  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1132 aa  2356    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848882  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.63 
 
 
319 aa  79  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 
366 aa  70.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  26.02 
 
 
688 aa  68.9  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
501 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  25.22 
 
 
352 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  24.25 
 
 
326 aa  67  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  26.33 
 
 
339 aa  66.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
330 aa  65.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
330 aa  65.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  24.56 
 
 
341 aa  64.7  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  24.4 
 
 
339 aa  64.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 
308 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  24.85 
 
 
343 aa  61.6  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  22.22 
 
 
337 aa  61.6  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  22.36 
 
 
339 aa  61.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 
338 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  23.59 
 
 
331 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  24.11 
 
 
340 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  23.28 
 
 
340 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  22.99 
 
 
340 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  23.1 
 
 
329 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  22.62 
 
 
338 aa  59.3  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  23.58 
 
 
340 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  22.99 
 
 
340 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  22.99 
 
 
340 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  22.99 
 
 
340 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  22.99 
 
 
340 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  22.69 
 
 
332 aa  57.4  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
337 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  22.92 
 
 
337 aa  57.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
313 aa  57  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26328  predicted protein  31.58 
 
 
517 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  24.42 
 
 
351 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  22.46 
 
 
329 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  23.85 
 
 
321 aa  56.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  29.34 
 
 
847 aa  56.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  23.97 
 
 
322 aa  55.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  24.11 
 
 
340 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  23.18 
 
 
327 aa  55.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
308 aa  55.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 
341 aa  55.5  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  23.55 
 
 
329 aa  55.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  24.61 
 
 
328 aa  55.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 
338 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  22.39 
 
 
340 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  22.29 
 
 
336 aa  54.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  22.59 
 
 
332 aa  54.3  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  23.61 
 
 
324 aa  54.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
317 aa  54.3  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
321 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  25.45 
 
 
342 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  24.11 
 
 
338 aa  53.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  25.07 
 
 
338 aa  53.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  23.96 
 
 
340 aa  53.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  23.24 
 
 
338 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  23.57 
 
 
337 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  22.02 
 
 
339 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.107811 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03119  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12770)  29.47 
 
 
316 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
334 aa  53.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  24.07 
 
 
319 aa  53.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  23.53 
 
 
338 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  24.67 
 
 
337 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  22.55 
 
 
336 aa  52.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
325 aa  52.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
788 aa  52.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.88 
 
 
724 aa  52.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  23.23 
 
 
337 aa  52.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  24.93 
 
 
338 aa  52.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  23.78 
 
 
339 aa  52.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  22.85 
 
 
335 aa  52.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  24.33 
 
 
337 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
331 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  21.25 
 
 
329 aa  52.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27190  predicted protein  23.47 
 
 
365 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  23.05 
 
 
338 aa  52.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  24.56 
 
 
339 aa  52  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
338 aa  52  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  21.99 
 
 
334 aa  51.6  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  22.53 
 
 
326 aa  51.6  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  23.31 
 
 
329 aa  51.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.64 
 
 
350 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.34 
 
 
309 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  24.01 
 
 
325 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  22.19 
 
 
327 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  23.21 
 
 
342 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  22.42 
 
 
351 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4069  hypothetical protein  20.71 
 
 
363 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487038  normal  0.116036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
338 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  23.83 
 
 
337 aa  50.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  24.63 
 
 
329 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  24.16 
 
 
337 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  23.95 
 
 
337 aa  50.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  20.79 
 
 
349 aa  50.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  23.44 
 
 
338 aa  50.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  21.99 
 
 
336 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.24 
 
 
321 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
332 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  21.88 
 
 
323 aa  50.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
319 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>