165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06500 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  100 
 
 		 153 aa  318  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  72.44 
 
 		 160 aa  226  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  68.39 
 
 		 155 aa  216  7e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  64.29 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  60.13 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  45.28 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  44.04 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  42.45 
 
 		 109 aa  101  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  40.37 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  41.18 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  40.37 
 
 		 108 aa  97.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  41.12 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  39.45 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  43.12 
 
 		 109 aa  93.6  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  41.28 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  41.28 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  41.28 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  43 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  40.19 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  42.72 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  41.51 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  43.43 
 
 		 114 aa  87  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  44.34 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  41.86 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  39.05 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  35.51 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  33.33 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  38.68 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  35.85 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  32.38 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  33.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  31.43 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  37.33 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  43.06 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  39.73 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  41.67 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  40.28 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  39.44 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  36.84 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  36.14 
 
 		 86 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  36 
 
 		 88 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  37.21 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  39.02 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  36.84 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  36.49 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0806  30S ribosomal protein S17  34.57 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00619499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  35.82 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  37.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  37.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  38.27 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  37.18 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  36.49 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  38.98 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  36.59 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  37.97 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 85 aa  43.9  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  36.99 
 
 		 81 aa  43.9  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  34.67 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  33.78 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  34.72 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  35.14 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>