35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0100 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 111 aa  226  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  69.52 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  51.38 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  50.46 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  52.83 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  51.46 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  47.57 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  46.6 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  47.57 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  51.38 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  49.04 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  49.54 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  50.46 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  48.54 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  43.69 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  49.51 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  46.08 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  45.63 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  46.6 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  45.36 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  48.08 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  49.52 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.74 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  38.68 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  45.71 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  40.57 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  37.04 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  51.16 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  35.85 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  34.15 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  39.71 
 
 		 86 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>