37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0628 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  86.99 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  84.93 
 
 		 147 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  85.12 
 
 		 124 aa  216  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  54.14 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  57.55 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  49.54 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  51.43 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  45.79 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  46.39 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  42.16 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  43.14 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  40.37 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  41.75 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  40.2 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  43.14 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  41.3 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  41.41 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  37.14 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  50 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  36.89 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  35.24 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  39.81 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.43 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  41.67 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  39.13 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  32.38 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  40.74 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  44.05 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  34.58 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  35.14 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  38.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  35.48 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>