47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0773 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  89.34 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  85.12 
 
 		 147 aa  193  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  85.12 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 111 aa  140  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  52.85 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  51.38 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  56.19 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  47.57 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  46.08 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  46.08 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  45.1 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  44.12 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  46.39 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  43.14 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  45.1 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  45.79 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  45.63 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  52.83 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  36.89 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  41.41 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.05 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  35.24 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  43.69 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  36.04 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  33.33 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  34.29 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  42.72 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  45.24 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  53.49 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  39.73 
 
 		 85 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  39.19 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  36 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  40 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  51.16 
 
 		 92 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  37.84 
 
 		 84 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  51.16 
 
 		 88 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>