More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1565 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  100 
 
 
86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  67.06 
 
 
89 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  69.77 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  67.44 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  69.77 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 
85 aa  110  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 
88 aa  110  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  65.88 
 
 
85 aa  108  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  67.06 
 
 
87 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 
87 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  63.53 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 
87 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 
107 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 
96 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 
87 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 
89 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
86 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 
96 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 
107 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
84 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 
88 aa  100  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
91 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  60.24 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  60 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
88 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  59.76 
 
 
98 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 
84 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
93 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  60.24 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  52.38 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  60 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  59.49 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  60.49 
 
 
87 aa  94.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  61.84 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  55.95 
 
 
85 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  56.79 
 
 
94 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  59.04 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 
92 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.76 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  56.96 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  58.54 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  60.29 
 
 
88 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  58.44 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
82 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
90 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
85 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  55.56 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  59.42 
 
 
83 aa  91.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  65.71 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  52.38 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  54.67 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  65.71 
 
 
86 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>