More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0990 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  100 
 
 
112 aa  226  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 
101 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 
89 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 
85 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 
84 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
84 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 
86 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
86 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
84 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  64.2 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  59.3 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  58.54 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  61.33 
 
 
90 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
85 aa  92  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  60 
 
 
85 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  57.33 
 
 
112 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  56.76 
 
 
88 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
86 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  58.02 
 
 
90 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
87 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
87 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
94 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
95 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  58.54 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
86 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  51.81 
 
 
85 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
90 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  58.67 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  58.02 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
102 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  54.02 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  56.79 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 
90 aa  84.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
92 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 
90 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  62.12 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>