More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4923 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  74.36 
 
 
86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  76.06 
 
 
89 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  68 
 
 
85 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
86 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  67.11 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  69.86 
 
 
90 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  60 
 
 
85 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
84 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
86 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 
89 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
84 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
107 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 
85 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
88 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  65.75 
 
 
86 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  59.74 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
87 aa  98.2  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
84 aa  97.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  55 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  60.81 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  62.34 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  58.97 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  62.16 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  57.14 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  50.51 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 
81 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
88 aa  92  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  58.23 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  53.75 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  53.75 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  58.23 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  60 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  60.81 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  54.05 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  61.33 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  49.41 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
84 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
91 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  53.33 
 
 
86 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0460  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
90 aa  88.6  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738553  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 
90 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  51.35 
 
 
89 aa  89  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
86 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 
99 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.76 
 
 
100 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  55 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  53.33 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  57.33 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
84 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  52.78 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  56.96 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_426  ribosomal protein S17  50.65 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>