More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  86.59 
 
 
98 aa  153  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  85.19 
 
 
95 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  81.61 
 
 
88 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  72.41 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  72.41 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17561  30S ribosomal protein S17  70.93 
 
 
88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17401  30S ribosomal protein S17  70.93 
 
 
88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  69.77 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  68.24 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  65.88 
 
 
86 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 
81 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  66.25 
 
 
83 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
86 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
93 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
84 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
84 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
84 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  60.26 
 
 
83 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  64.94 
 
 
85 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
89 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  56.25 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  63.01 
 
 
94 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  55.84 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
99 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  58.23 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  58.67 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  51.95 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  59.72 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  54.67 
 
 
85 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  58.97 
 
 
94 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  65.67 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  51.76 
 
 
101 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  56.16 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  58.23 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  55.84 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  55.84 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  57.53 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  51.95 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  58.44 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  55.84 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.86 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  56.16 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  58.67 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>