More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0611 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  77.38 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  72.62 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  73.17 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  73.17 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  69.05 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  68.67 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  69.05 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 84 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  68.67 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  65.43 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  65.48 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  67.47 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  63.41 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  63.41 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  67.53 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 83 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>