More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1669 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  80 
 
 		 78 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  75.95 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  75.95 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  75.95 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  80 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 		 80 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 		 80 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  76 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  76 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  74.07 
 
 		 82 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  71.62 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  68.75 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  71.05 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 82 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 80 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 80 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  67.12 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  70.67 
 
 		 78 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 76 aa  97.1  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 76 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 76 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 89 aa  93.2  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  65.67 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  63.24 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  63.24 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  64.18 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  59.15 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  63.24 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  60.87 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  60.87 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  63.24 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  59.15 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  62.69 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 88 aa  85.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  60.87 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  65.67 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  62.69 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  62.12 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  61.19 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>