More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0851 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  100 
 
 		 101 aa  204  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  68.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  73.17 
 
 		 87 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  69.23 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  63.04 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  65.88 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  65.12 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  70.24 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  58.7 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  61.96 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  62.35 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  72.6 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  72.6 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  72.6 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  72.6 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 90 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  63.33 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  71.23 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  60.22 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  59.55 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  61.96 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  59.14 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  59.14 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  64.04 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  62.92 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  64.04 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  68.49 
 
 		 82 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  62.92 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  68.49 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  65.48 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  71.23 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  57.3 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  60.61 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  59.78 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  59.78 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  59.78 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  59.78 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  58.59 
 
 		 99 aa  106  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  57.45 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  67.09 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  61.84 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.07 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  67.12 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  61.25 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  58.7 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  58.7 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>