More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0234 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 85 aa  123  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  72.94 
 
 		 94 aa  120  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  65.06 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  62.35 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  68 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 84 aa  105  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  57.83 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>