More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2705 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
84 aa  168  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  98.81 
 
 
84 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  78.57 
 
 
85 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  80.72 
 
 
89 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  75.9 
 
 
86 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  75.61 
 
 
86 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  71.43 
 
 
85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 
88 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 
93 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
84 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  70.24 
 
 
84 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 
84 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  73.17 
 
 
96 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  71.08 
 
 
93 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  73.49 
 
 
98 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
91 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 
120 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
86 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
96 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  72.29 
 
 
90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  71.08 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  73.42 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
84 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  72.15 
 
 
100 aa  117  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 
102 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
102 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 
96 aa  114  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 
87 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  68.67 
 
 
108 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 
91 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  69.05 
 
 
85 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  65.85 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  70.89 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  65.85 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  70.73 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  65.85 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  70.73 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
87 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  66.27 
 
 
87 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  67.47 
 
 
102 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  66.27 
 
 
101 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  65.06 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
99 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  68.67 
 
 
93 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  68.29 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  71.05 
 
 
84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  64.63 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  64.63 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  64.63 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 
85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
84 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 
90 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  63.1 
 
 
86 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
95 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
87 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  61.45 
 
 
85 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
88 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  63.86 
 
 
94 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 
86 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
98 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  65.85 
 
 
94 aa  104  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  62.5 
 
 
84 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
88 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  64.63 
 
 
88 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
99 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 
85 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  64.63 
 
 
102 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  66.27 
 
 
86 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
87 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
85 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 
85 aa  103  7e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
85 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 
85 aa  103  7e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
85 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>