More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1129 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
100 aa  201  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  68 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
107 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
107 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  62.07 
 
 
101 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  64 
 
 
88 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  64 
 
 
88 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  64 
 
 
84 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  68 
 
 
94 aa  104  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 
86 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
90 aa  103  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  64.1 
 
 
85 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 
84 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
84 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  56.16 
 
 
89 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
101 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 
84 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  50.53 
 
 
110 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  62.67 
 
 
85 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 
88 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
88 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 
90 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  59.21 
 
 
86 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  60.26 
 
 
87 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  68 
 
 
99 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  55 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  63.24 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
89 aa  96.7  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
84 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  59.21 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  56.41 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  55.84 
 
 
84 aa  94.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  55.41 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  55.41 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  65.33 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  50.51 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  67.19 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
82 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
85 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  58.23 
 
 
84 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 
88 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
82 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 
89 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 
89 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
82 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
96 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
86 aa  93.6  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
82 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
82 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
82 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  56 
 
 
82 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 
89 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
93 aa  93.2  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>