More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0188 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  60.47 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  63.1 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  58.14 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  59.3 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  61.18 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  61.64 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  62.79 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  61.63 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  59.76 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>