More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1194 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  76.34 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  77.01 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  75.82 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  78.48 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  75.82 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  74.71 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  78.31 
 
 		 94 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  78.48 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  81.01 
 
 		 99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  81.01 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  77.5 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  72.41 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  79.75 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  79.75 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  71.26 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  72.41 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 		 102 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  73.56 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  72.41 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  69.77 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  72.09 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  74.68 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  71.26 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  70.51 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  67.02 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  74.68 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  70 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  70.51 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  70.89 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  67.5 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  65 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  68.35 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  68.35 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  68.35 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  67.09 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  63.95 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  63.1 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  68.35 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  65.82 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  68.35 
 
 		 99 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  68.06 
 
 		 83 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  65.48 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  69.44 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  65.82 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  62.79 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  61.18 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  64 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  68.75 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  59.49 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  59.77 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 		 80 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 		 80 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>