More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2027 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  89.29 
 
 		 85 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 81 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 83 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 82 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  63.51 
 
 		 83 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  59.76 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  55.56 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  54.32 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  54.32 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  54.32 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 91 aa  91.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  52.44 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  57.83 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0498  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  53.09 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>