More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0120 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
87 aa  173  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  91.95 
 
 
87 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  91.95 
 
 
87 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  90.8 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  89.66 
 
 
87 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  87.36 
 
 
87 aa  154  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  87.36 
 
 
87 aa  153  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  87.36 
 
 
87 aa  153  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  82.35 
 
 
86 aa  147  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  82.35 
 
 
86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  80 
 
 
88 aa  142  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  81.18 
 
 
86 aa  141  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  78.82 
 
 
88 aa  135  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  76.19 
 
 
85 aa  135  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  77.65 
 
 
88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  73.81 
 
 
85 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  72.62 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  73.26 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  74.12 
 
 
89 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 
91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 
84 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
85 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 
84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
84 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  71.08 
 
 
93 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  67.86 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  60.71 
 
 
87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  71.05 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  67.06 
 
 
86 aa  107  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  58.62 
 
 
91 aa  105  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
86 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  58.62 
 
 
91 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  69.14 
 
 
96 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  64.63 
 
 
85 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 
84 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  68.29 
 
 
98 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
86 aa  105  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  67.07 
 
 
93 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 
100 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
85 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 
135 aa  104  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
93 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  62.65 
 
 
101 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
96 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  58.62 
 
 
86 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  63.86 
 
 
93 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
85 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  67.9 
 
 
86 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
94 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  61.73 
 
 
98 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 
102 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
84 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
99 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  62.96 
 
 
98 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 
120 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
90 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
96 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  59.21 
 
 
95 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  65.85 
 
 
84 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
88 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 
94 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  56.82 
 
 
88 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
86 aa  100  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 
99 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
88 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  65.43 
 
 
93 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
102 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  65.85 
 
 
93 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 
91 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 
90 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  64.2 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  63.41 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  62.65 
 
 
108 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
88 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 
91 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
88 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  62.2 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  62.2 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>