More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6605 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  76.34 
 
 		 93 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  78.49 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  76.34 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  78.49 
 
 		 91 aa  144  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  77.42 
 
 		 91 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  77.42 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  71.72 
 
 		 99 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  73.12 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  72.92 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  72.22 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  69.57 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  72.34 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  74.19 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  69.23 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  79.27 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  76.83 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  71.58 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  70.21 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  70.33 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  65.59 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  73.26 
 
 		 101 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  75.61 
 
 		 100 aa  126  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  65.69 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  70.93 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  72.09 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  70.93 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  72.29 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  72.29 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  68.54 
 
 		 99 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  69.77 
 
 		 98 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  65.96 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  68.6 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  67.47 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  65.22 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  61.18 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  58.06 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  60 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  63.1 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  54.84 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 85 aa  94.4  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  56.96 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  55.95 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  90.5  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>