More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  86.36 
 
 		 90 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  85.87 
 
 		 98 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  82.11 
 
 		 99 aa  160  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  89.41 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  77 
 
 		 101 aa  147  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  73 
 
 		 94 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  78.89 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  77.78 
 
 		 91 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  70.48 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  72 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  71 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  72.63 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  76.14 
 
 		 90 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  62.96 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  78.31 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  74.44 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  70 
 
 		 99 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  73.63 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  65.69 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  67.68 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  76.83 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  77.5 
 
 		 88 aa  129  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  76.83 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  75.61 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  67.37 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  74.39 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  75.61 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  70.93 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  67 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  74.39 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  74.39 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  74.39 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  73.17 
 
 		 98 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  61 
 
 		 93 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  70.37 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  61.96 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  59.3 
 
 		 86 aa  105  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  59.49 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  54.84 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  59.76 
 
 		 87 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  51 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 82 aa  100  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  50.54 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>