More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0224 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  80.25 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  75.58 
 
 		 86 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  74.12 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  72.73 
 
 		 87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 85 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 84 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 84 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 84 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 91 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  72.84 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  67.9 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  70.37 
 
 		 98 aa  120  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  70.51 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  69.14 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  65.85 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  67.9 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  65.43 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  60.47 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  61.63 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 93 aa  110  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  61.9 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  63.1 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  57.95 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  60.47 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  62.79 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  60.49 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 87 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  58.82 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  69.14 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55.7 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  58.02 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  59.21 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>