More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0300 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  78.16 
 
 
88 aa  137  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  72.62 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  69.32 
 
 
88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
85 aa  125  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
87 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  69.32 
 
 
88 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
86 aa  121  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
86 aa  120  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
87 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
87 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
85 aa  120  9e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  63.22 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  69.23 
 
 
86 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
138 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  62.07 
 
 
86 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  60.98 
 
 
84 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  59.77 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
87 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
84 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  52.44 
 
 
85 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  59.26 
 
 
86 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
88 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  55.17 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  54.44 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
99 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  51.72 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 
86 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
120 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  50.6 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  55.42 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  58.62 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55.41 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  53.66 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  56.16 
 
 
112 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  52.27 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  54.32 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  51.72 
 
 
88 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  51.72 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  51.16 
 
 
93 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  55.56 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  53.57 
 
 
93 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  52.44 
 
 
93 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  53.49 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  51.85 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
85 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
107 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  51.85 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
84 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  54.32 
 
 
85 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  51.85 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  53.57 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  50.57 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  51.19 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  50.57 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>