More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1564 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  55.17 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  57.47 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  57.47 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  46.51 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  46.51 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  55.17 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  58.9 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 94 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  46.34 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  48.28 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  53.85 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  45.35 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  49.43 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  54.65 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  50 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  54.67 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  53.33 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  60.29 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  54.79 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  51.76 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>